- Oggetto:
- Oggetto:
Biochimica
- Oggetto:
Biochemistry
- Oggetto:
Anno accademico 2017/2018
- Codice dell'attività didattica
- VET0205
- Docente
- Prof. Paolo CASCIO (Responsabile)
- Anno
- 1° anno
- Tipologia
- Corso monodisciplinare
- Crediti/Valenza
- 5
- SSD dell'attività didattica
- BIO/10 - biochimica
- Modalità di erogazione
- Tradizionale
- Lingua di insegnamento
- Italiano
- Modalità di frequenza
- Facoltativa
- Tipologia d'esame
- Scritto
- Prerequisiti
-
PROPEDEUTICITA'
C.I. CHIMICA
Prerequisites'C.I. CHEMISTRY
- Propedeutico a
- CI Fisiologia veterinaria e principi di etologia applicata
Veterinary Physiology and Applied Etology Principles - Oggetto:
Sommario insegnamento
- Oggetto:
Obiettivi formativi
Il corso si propone di presentare i dati biochimici nel loro contesto funzionale, partendo dal livello molecolare sino alla complessità di organizzazione da cui risulta il funzionamento di tessuti, organi e apparati. Lo studente dovrà apprendere i concetti biochimici e molecolari dell'organizzazione strutturale e funzionale delle cellule e dei processi metabolici cellulari, con particolare riferimento al metabolismo energetico e alla struttura e funzioni degli acidi nucleici e ai loro meccanismi regolatori. Durante il corso lo studente acquisirà anche le nozioni generali sui principi e sulle metodiche dell'analisi biochimica e sulla interpretazione dei dati sperimentali.The course aims to present the biochemical data in their functional context, ranging from the molecular level to the complexity of the organization that results in the functioning of tissues, organs and apparatus. The student will need to learn the biochemical and molecular concepts of the structural and functional organization of cells and cellular metabolic processes, with particular reference to energy metabolism and the structure and functions of nucleic acids and their regulatory mechanisms. During the course, the student will also acquire the general knowledge about principles and methods of biochemical analysis and interpretation of experimental data.- Oggetto:
Risultati dell'apprendimento attesi
Durante la prova d'esame lo studente dovrà dimostrare di aver acquisito i concetti essenziali relativi ai vari cicli metabolici trattati a lezione. Dovrà, inoltre, saper mettere in relazione i vari argomenti dimostrando capacità di ragionamento, avendo ben chiara la valenza interdisciplinare della materia. Inoltre lo studente dovrà dimostrare di aver compreso i principi e le nozioni fondamentali relativi alla struttura e al funzionamento degli acidi nucleici e delle proteine ed essere in grado di valutarne le conseguenze sulla regolazione di alcuni importanti processi cellulari. Mediante le esercitazioni pratiche, svolte a piccoli gruppi, dovrà acquisire la capacità di lavorare con i compagni, riprendere le norme sull'utilizzo dei principali strumenti di laboratorio, preparare soluzioni standard di proteine, eseguire gli spettri di assorbimento tramite lo spettrofotometro, imparare a costruire una curva di taratura, dimostrando di essere in grado di elaborare i dati sperimentali.During the exam, the student will have to demonstrate that he has acquired the essential concepts related to the various metabolic processes treated in the lesson. It will also have to be able to relate the various arguments demonstrating reasoning skills, having clear the interdisciplinary value of the subject. In addition, the student must demonstrate that he has understood the basics and notions about the structure and functioning of nucleic acids and proteins and be able to evaluate the consequences on the regulation of some important cellular processes. Through practical exercises, done in small groups, you will have to be able to work with your companions, resume the rules on the use of the main laboratory tools, prepare standard protein solutions, perform absorption spectra through the spectrophotometer, learn how to build a calibration curve, demonstrating that it is able to process experimental data.- Oggetto:
Modalità di insegnamento
42 ore di lezioni teoriche e 8 ore di esercitazioni pratiche in laboratorio.42 hours of theorical lessons and 8 hours of practical exercises in the laboratory.- Oggetto:
Modalità di verifica dell'apprendimento
Prova scritta in itinere (test a risposte multiple, 10 domande) inerente la parte di Biologia Molecolare e prova scritta finale (test a risposte multiple, 30 domande; 20 se si è già superata la prova in itinere).Written in itinere (Multiple Response Test, 10 questions) inherent in the Molecular Biology part and final written test (multiple response test, 30 questions, 20 if you have already passed the test in itinere).- Oggetto:
Attività di supporto
- Oggetto:
Programma
Introduzione alla biochimica: organismi autotrofi ed eterotrofi, metabolismo, anabolismo, catabolismo, lavoro, energia, sistemi chiusi e aperti, variazione di energia interna, variazione di energia libera e direzione delle reazioni, reazioni termodinamicamente favorevoli, reazioni accoppiate, energia di attivazione, velocità delle reazioni, azione degli enzimi, concetti generali di catalisi enzimatica: definizione enzimi, nomenclatura e proprietà generali. Catalisi enzimatica: intermedi di reazione, complessi ES e EP, energia di attivazione per gli stati di transizione. Meccanismi di abbassamento dell'energia di attivazione ad opera degli enzimi. Teorie chiave-serratura e dell'adattamento indotto. Fattori che influenzano la velocità di reazione: T°, pH, concentrazione enzima e substrato. Nomenclatura enzimi, sistema EC, 6 principali classi di enzimi. Enzimi nel sangue come marcatori diagnostici. Cinetica enzimatica: velocità di reazione, velocità iniziale, stato stazionario, Vmax, saturazione dell'enzima, equazione di Michaelis-Menten, significato e determinazione di Vmax e Km. Regolazione dell'attività enzimatica: controllo a livello del substrato, regolazione a feedback, modificazione covalente della molecola enzimatica (fosforilazione-defosforilazione), induzione o repressione genica della biosintesi della proteina enzimatica. Inibizione attività enzimatica: inibizione irreversibile, inibizione reversibile competitiva. Inibitori enzimatici come farmaci: aspirina, inibitori ACE, penicillina, statine. Introduzione al metabolismo, catabolismo, anabolismo, organismi fototrofi, chemiolitotrofi, eterotrofi, aerobi, anaerobi facoltativi, anaerobi obbligati, ossidazioni biologiche, modalità per il trasferimento di elettroni da una specie chimica ad un'altra, elettronegatività, liberazione di energia durante le reazioni redox, stati di ossidazione del carbonio, stadi catabolismo, cenni sui motivi della grande variazione di energia associata all'idrolisi dell'ATP. Digestione dei carboidrati, glicemia, effetti metabolici insulina e glucagone, fosforilazione del glucosio. Metabolismo glicidico: glicolisi anaerobia, gluconeogenesi, glicogenolisi e glicogenosintesi. Decarbossilazione ossidativa del piruvato. Ciclo di Krebs. Fosforilazione ossidativa. Significato metabolico dei lipidi. Digestione ed assorbimento dei lipidi. Principali classi di lipoproteine e loro significato metabolico. Metabolismo lipidico: catabolismo degli acidi grassi (beta ossidazione), significato metabolico dei corpi chetonici, cenni sulla sintesi degli acidi grassi, sintesi e catabolismo dei trigliceridi. Catabolismo generale degli aminoacidi: transaminazione, desaminazione ossidativa, destino dell'ammoniaca, cenni sul ciclo dell'urea. Ruolo degli ormoni nella regolazione di questi metabolismi. Struttura, proprietà chimico-fisiche e funzioni degli acidi nucleici. Accrescimento 5'-3'degli acidi nucleici. Organizzazione del DNA nei procarioti e negli eucarioti. Modalità e complessi enzimatici coinvolti nella duplicazione del DNA nei procarioti e negli eucarioti. Definizione del gene. Codice genetico: triplette, degenerazione del codice genetico, vacillamento della terza base, codoni di Stop. Modalità e complessi enzimatici coinvolti nei processi di trascrizione e traduzione nei procarioti. Sintesi proteica nei procarioti.Argomenti delle esercitazioni
Allestimento di una curva di taratura e determinazione quantitativa di proteine in un campione mediante diverse (Lowry e Bradford) tecniche spettrofotometriche. PCR e separazione elettroforetica di acidi nucleici (gel di agaroso) e di proteine (SDS-Page).
Introduction to biochemistry: autotrophic and heterotrophic organisms, metabolism, anabolism, catabolism, work, energy, closed and open systems, internal energy variation, free energy variation and direction of reactions, thermodynamically favorable reactions, coupled reactions, activation energy, speed reactions, action of enzymes, general concepts of enzymatic catalysis: enzyme definition, nomenclature and general properties. Enzymatic catalysis: reaction intermediates, ES and EP complexes, activation energy for transition states. Mechanisms of lowering the activation energy by enzymes. Key-locking theories and induced adaptation. Factors that influence reaction speed: T °, pH, enzyme concentration and substrate. Enzymes nomenclature, EC system, 6 major classes of enzymes. Blood Enzymes as Diagnostic Markers. Enzyme kinetics: reaction rate, initial speed, stationary state, Vmax, enzyme saturation, Michaelis-Menten equation, meaning and determination of Vmax and Km. Enzyme activity adjustment: substrate level control, feedback regulation, covalent modification of the enzymatic molecule (phosphorylation-dephosphorylation), induction or gene repression of the enzymatic protein biosynthesis. Inhibition of enzymatic activity: irreversible inhibition, competitive reversible inhibition. Enzyme inhibitors like drugs: aspirin, ACE inhibitors, penicillin, statins. Introduction to Metabolism, Catabolism, Anabolism, Phototrophic Organisms, Chemiolithotrophs, Heterotrophs, Aerobes, Optional anaerobes, Obligatory anaerobes, Organic Oxidations, Modes for Transferring Electrons from One Chemical to Another, Electronegativity, Energy Release during Redox Reactions , carbon oxidation states, catabolism stages, notes on the reasons for the large variation in energy associated with the hydrolysis of ATP. Digestion of carbohydrates, blood glucose, insulin and glucagon metabolic effects, glucose phosphorylation. Glycidic metabolism: anaerobic glycolysis, gluconeogenesis, glycogenolysis and glycogen synthesis. Pyruvate oxidative decarboxylation. Krebs cycle. Oxidative phosphorylation. Meaning of lipid metabolism. Digestion and absorption of lipids. Major classes of lipoproteins and their metabolic significance. Lipid metabolism: fatty acid catabolism (beta oxidation), metabolic significance of ketone bodies, synthesis of fatty acids, synthesis and catabolism of triglycerides. General aminoacid catabolism: transamination, oxidative desamination, fate of ammonia, acute ubiquitous details. The role of hormones in regulating these metabolisms. Structure, chemical-physical properties and functions of nucleic acids. 5'-3 growth of nucleic acids. Organizing DNA in prokaryotes and eukaryotes. Methods and enzymatic complexes involved in duplication of DNA in prokaryotes and eukaryotes. Definition of the gene. Genetic code: triplet, degeneration of the genetic code, floating of the third base, Stop codons. Methods and enzymatic complexes involved in transcription and translation processes in prokaryotes. Protein synthesis in prokaryotes.Exercises topics
Provision of a calibration curve and quantitative determination of proteins in a sample using different (Lowry and Bradford) spectrophotometric techniques. PCR and electrophoretic separation of nucleic acids (agarose gel) and proteins (SDS-Page).Testi consigliati e bibliografia
- Oggetto:
Visto il costo piuttosto elevato dei testi di Biochimica, non si ritiene opportuno indicare un testo specifico di riferimento. Qualunque testo universitario di Biochimica (magari già in possesso o comunque reperibile dagli studenti) può, pertanto, essere adatto allo scopo. Quella che segue è una lista (non esaustiva) di testi utlizzabili dagli studenti.
- Siliprandi, Tettamanti -"Biochimica Medica"- Piccin Ed.
- Denise R. Ferrier - "Le basi della Biochimica"- Zanichelli Ed.
- Horton, Moran, Scrimgeour, Perry, Rawn - Principi di Biochimica - IV ed.-Pearson Prentice Hall Ed.
- Lange Harper - Biochimica - 26/Ed. - Mc Graw Hill Ed.
- Berg, Tymoczko, Stryer - Biochimica (VI edizione) - Zanichelli
- Nelson, Cox - Introduzione alla biochimica di Lehninger - Zanichelli
- Watson J.D.: DNA ricombinante. Zanichelli.
- Lodish H.: Biologia molecolare della cellula. Zanichelli.
- Allison L.A.: Fondamenti di biologia molecolare. Zanichelli.
- Lewin B.: Il gene. Zanichelli.
- Dean R. Appling: Biochimica, Molecole e metabolismo. Pearson
- Materiale didattico fornito nel corso delle esercitazioni in laboratorio
Given the rather high cost of the Biochemistry texts, it is not considered appropriate to indicate a specific reference text. Any university text of Biochemistry (perhaps already in possession or however available from the students) can, therefore, be suitable for the purpose. The following is a (non-exhaustive) list of texts that can be used by the students.- Siliprandi, Tettamanti -"Biochimica Medica"- Piccin Ed.
- Denise R. Ferrier - "Le basi della Biochimica"- Zanichelli Ed.
- Horton, Moran, Scrimgeour, Perry, Rawn - Principi di Biochimica - IV ed.-Pearson Prentice Hall Ed.
- Lange Harper - Biochimica - 26/Ed. - Mc Graw Hill Ed.
- Berg, Tymoczko, Stryer - Biochimica (VI edizione) - Zanichelli
- Nelson, Cox - Introduzione alla biochimica di Lehninger - Zanichelli
- Watson J.D.: DNA ricombinante. Zanichelli.
- Lodish H.: Biologia molecolare della cellula. Zanichelli.
- Allison L.A.: Fondamenti di biologia molecolare. Zanichelli.
- Lewin B.: Il gene. Zanichelli.
- Dean R. Appling: Biochimica, Molecole e metabolismo. Pearson
- Didactic material provided during laboratory exercises
- Oggetto:
Note
PROPEDEUTICITA'C.I. CHIMICA
Prerequisites'
C.I. CHEMISTRY- Oggetto:
